Thông tin từ Sở TN&MT Kon Tum cho biết, hiện tượng nước có màu xanh ở lòng hồ thủy điện Yaly là do dư thừa chất dinh dưỡng và tảo đột biến, bị phân hủy làm nước có màu xanh, nổi váng (còn gọi là hiện tượng "tảo nở hoa").
Qua kiểm tra, lực lượng chức năng xác định nguyên nhân dẫn đến ô nhiễm khu vực lòng hồ thủy điện YaLy là do người dân thu hoạch sắn nhưng còn sót lại cây và củ, khi bị ngập nước bị thối rữa.