Từ lâu, những đồng cỏ biển đã trở thành "nạn nhân" của các hoạt động liên quan tới tàu, thuyền. Ước tính khoảng 7.500 ha cỏ Neptune đã bị tàn phá chỉ tính riêng dọc bờ biển của Pháp.
Cỏ biển có thể làm giảm tính axit của vùng nước xung quanh, một chức năng đặc biệt quan trọng khi các đại dương hấp thụ CO2 từ khí quyển và sản sinh ra nhiều axit hơn.