Theo WHO, cách phòng tránh virus Marburg tốt nhất là tránh tiếp xúc với các loài động vật hoang dã có nguy cơ mang mầm bệnh. Đồng thời, hạn chế hoặc sử dụng các biện pháp phòng tránh với những người bị nghi ngờ mắc bệnh, người đi từ các nước Tây Phi về.