Rất nhiều nhà khoa học đã cảnh báo, không thể khai thác mỏ sắt Thạch Khê vì nhiều lý do. Quan trọng nhất có lẽ là vấn đề liên quan tới công nghệ khai thác và môi trường.
Chỉ từ đầu năm 2021 đến nay, các cơ quan chức năng đã liên tục phát hiện, xử lý nhiều vụ khai thác than trái phép, gây thất thoát hàng triệu tấn tài nguyên khoáng sản thiên nhiên.