Báo cáo của UBND tỉnh Hà Giang đã chỉ ra hàng loạt tồn tại của các nhà máy thủy điện như: vận hành phát điện nhưng chưa có giấy phép khai thác nước mặt, không duy trì dòng chảy tối thiểu; chưa phê duyệt phương án ứng phó với tình huống khẩn cấp... gây lo ngại về rủi ro an toàn vận hành nhà máy.